El Verde disputó dos definiciones por el título de la Liga Nacional de Básquet a lo largo de su historia, con un campeonato y un subcampeonato.
Gimnasia y Esgrima de Comodoro Rivadavia disputó dos finales por el título de la Liga Nacional de Básquet a lo largo de su historia. En una de ellas se consagró campeón y en la otra obtuvo el subcampeonato.
Campeón en la temporada 2005/06
En la temporada 2005/06, Gimnasia de Comodoro se consagró campeón de la Liga Nacional tras vencer a Libertad de Sunchales por 4-2 en la serie decisiva. El plantel estuvo integrado por Gabriel Cocha, Pablo Moldú, Leandro Masieri, Sebastián Festa, Ruperto Herrera, Jervaughn Scales, Charles Jones, Damon Thornton, Bruce Zabukovic, Matías Barberis, Santiago Haag, Nicolás De los Santos y Diego Romero. El entrenador era Fernando Duró.
Subcampeón en la temporada 2014/15
En la temporada 2014/15, bajo la denominación Gimnasia Indalo, el equipo cayó frente a Quimsa de Santiago del Estero por 4-2 en la final. El plantel incluyó a Nicolás De los Santos, Leonel Schattmann, Sam Clancy Jr., Federico Aguerre, Santiago Scala, Diego Cavaco, Diego Guaita, Pablo Orlietti, Federico Giarrafa, Maranesi, Thorp y Roumec. El entrenador era Gonzalo García.
Próxima final
Gimnasia de Comodoro jugará la final de la Liga Nacional de Básquetbol 2025/26 ante Quimsa de Santiago del Estero, a partir del sábado 6 de junio, desde las 19 hs.